常見問題
已知一個(gè)基因,其翻譯的蛋白很可能是分泌蛋白,用煙草做亞細(xì)胞定位的話,后期需不需要做質(zhì)壁分離處理?如果需要,應(yīng)該怎么做?
答:當(dāng)目標(biāo)蛋白為分泌肽或含信號(hào)肽結(jié)構(gòu),預(yù)測(cè)定位于細(xì)胞外基質(zhì)時(shí),可先做初步定位,觀察其是否存在胞質(zhì)彌散或細(xì)胞邊緣聚集的定位情況,也可對(duì)分泌蛋白進(jìn)行監(jiān)測(cè)?,分別在侵染后24h、48h、72h取樣,觀察熒光從內(nèi)質(zhì)網(wǎng)→高爾基體→囊泡的動(dòng)態(tài)遷移?。如有,可追加質(zhì)壁分離驗(yàn)證;對(duì)于明確為胞內(nèi)細(xì)胞器定位的蛋白則無(wú)需質(zhì)壁分離。
?質(zhì)壁分離的最佳處理時(shí)間?是在熒光蛋白充分表達(dá)后(農(nóng)桿菌注射后48-72小時(shí))進(jìn)行,過早處理易因蛋白表達(dá)不足導(dǎo)致信號(hào)微弱。
?【操作流程】:① ?葉片處理?:切取表達(dá)熒光融合蛋白的煙草葉片(約1cm2)。② 浸入 ?0.5–0.8 M蔗糖溶液?(高滲液)中,避光孵育10-15分鐘。③? 顯微觀察?:將葉片置于載玻片上,加蓋玻片輕壓,激光共聚焦顯微鏡下觀察。?原生質(zhì)體與細(xì)胞壁分離形成空隙表明質(zhì)壁分離成功。?④ 定位判定熒光信號(hào)位于空隙處(質(zhì)外體),或附著于收縮的原生質(zhì)體(膜結(jié)合)。
【注意事項(xiàng)】:① 質(zhì)壁分離會(huì)破壞細(xì)胞膜完整性并改變蛋白分布環(huán)境,而分泌蛋白的定位需在活細(xì)胞或接近生理狀態(tài)下觀察,以保持其動(dòng)態(tài)分泌過程的真實(shí)性。實(shí)驗(yàn)處理不當(dāng)會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞破裂或死亡,熒光信號(hào)彌散。因此?蔗糖濃度需要優(yōu)化,蔗糖處理時(shí)間嚴(yán)格控制在10-15分鐘。② 滲透脅迫可誘導(dǎo)蛋白錯(cuò)誤定位(如應(yīng)激蛋白向膜遷移)?,應(yīng)該進(jìn)行關(guān)鍵對(duì)照實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),觀察排除。③ 為避免細(xì)胞邊緣聚集的蛋白被誤判為膜定位,可通過細(xì)胞收縮后觀察熒光是否隨細(xì)胞膜移動(dòng)來區(qū)分,也可與膜定位marker共定位。?同時(shí)也要連續(xù)掃描同一細(xì)胞區(qū)域(間隔5-10分鐘),確認(rèn)信號(hào)無(wú)彌散或偏移,從而對(duì)定位穩(wěn)定性進(jìn)行驗(yàn)證。?
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